Ingénieur/e chargé/e de recherche en Protéomique et Signalisation Redox (H/F)

Présentation du projet :
Le projet ERXCUE, financé par l’ANR, vise à étudier comment les cellules s’adaptent – ou
échouent à s’adapter – au stress du réticulum endoplasmique (ER), en se concentrant sur le
remaniement du métabolisme thiol-redox. L'objectif est d'identifier les processus redox qui
influencent la décision cellulaire entre la survie et l’apoptose lors de la réponse aux protéines non
repliées (UPR). En combinant des approches -omiques non biaisées et des études ciblées au niveau
protéomique subcellulaire, l’ingénieur/e sera explorera comment les activités redox participent à la
régulation de l'UPR et au destin cellulaire.

Missions & responsabilités :
• Analyse Protéomique et Redoxomique :
o Concevoir et réaliser des expériences de spectrométrie de masse (LC-MS/MS) pour
identifier et quantifier les modifications redox et post-traductionnelles dans les
protéines impliquées dans l’UPR.
o Se concentrer sur les modifications des thiols et les protéines redox-actives.
• Intégration des Données :
o Intégrer les données de protéomique redox avec les données de transcriptomique
pour créer une cartographie complète des voies redox régulées par l’UPR.
o Utiliser des outils de bioinformatique pour corréler les données protéomiques avec
les états redox cellulaires et les transitions UPR.
• Conception Expérimentale :
o Développer et optimiser des méthodes de fractionnement subcellulaire et de redoxomique ciblant des organites spécifiques, en particulier le réticulum endoplasmique (ER).
o Mettre en œuvre des workflows innovants pour cartographier les modifications
redox spécifiques à l’ER et l’activité redox sous conditions de stress UPR.
• Recherche Collaborative :
o Travailler en étroite collaboration avec les équipes de biologie redox et de métabolomique pour comprendre comment les changements dans le métabolisme
thiol-redox et d'autres voies affectent les réponses cellulaires au stress de l'ER.
o Étudier le remaniement métabolique sous UPR et son impact sur le protéome.

Profil recherché :
Connaissances et qualités recherchées :
• Principes et expériences en analyse protéomique,
• Traitement des données quantitatives de protéomique,
• Culture cellulaire humaine
• Connaissance du langage R
Diplome : PhD en biochimie, chimie analytique, biologie
Expérience souhaitée : 3ans

L'employeur :
L’ESPCI Paris – PSL (École Supérieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris) est une école d’ingénieurs généraliste qui forme, depuis 1882, des ingénieurs de rupture, adaptables et créatifs, dotés d’un solide bagage théorique et expérimental, conscients des enjeux de la société.
Elle est intégrée à un centre de recherche reconnu internationalement en physique, chimie et biologie (500 publications par an). Elle est connue pour sa capacité à transformer les connaissances issues de la recherche fondamentale en innovations de rupture (2 brevets par mois, 3 start-ups par
an).

Distinguée par 6 Prix Nobel, elle accueille 400 élèves-ingénieurs, 530 chercheurs (dont 250 doctorants et 100 post-doctorants) dans 10 unités mixtes de recherche et environ 100 agents des fonctions support de la recherche et de l’enseignement.
Depuis sa création, l’ESPCI n’a cessé de mobiliser ses forces et compétences au service de sujets
sociétaux majeurs et de défendre l’importance de la science au service de la société.
L’environnement, la solidarité, la santé, l’accès et l’ouverture au savoir sont des enjeux que l’ESPCI
s’est engagée à prendre en compte dans son quotidien tout en contribuant à les faire avancer.
L’ESPCI défend l’égalité des chances et promeut la diversité sociale. Elle encourage et valorise l’engagement, notamment associatif, de ses étudiants.
Descriptif du service
L’ingénieur/e sera rattaché/e au laboratoire de Spectrométrie de Masse Biologique et Protéomique
de l’ESPCI Paris (SMBP, dirigé par Joelle Vinh), sous la supervision de Giovanni Chiappetta