Post-Doctorant/Post-Doctorante Expériences d'altération des roches par des écosystèmes microbiens sous

La vie a-t-elle façonné la surface de la Terre primitive ? Pendant la majeure partie de son histoire, les micro-organismes ont été les seules formes de vie à peupler l'océan et les continents, dans un monde caractérisé par un jeune Soleil faible, une atmosphère et des océans anoxiques, et potentiellement sans tectonique des plaques. L'altération des roches régule le système carbone-climat ainsi que l'habitabilité d'une planète, et les micro-organismes peuvent l'influencer directement (par leur métabolisme) ou indirectement (par les réactions chimiques dans lesquelles ils sont impliqués). L’une des doctorantes affectées au projet a conçu et construit un dispositif expérimental au CEREEP ECOTRON Île-de-France qui reproduit l'altération des roches dans des conditions similaires à celles de l'Archéen, avec et sans l'apport d'un écosystème microbien issu des eaux anoxiques du lac Pavin, un lac de maar ferrugineux situé dans le Massif central. Les étalonnages eau-roche et eau-air ainsi que les tests de stérilisation sont terminés : les expériences sont prêtes à démarrer et nous cherchons à compléter l'équipe.

Avez-vous de l'expérience en écologie microbienne, en géomicrobiologie ou en astrobiologie, ainsi qu'en cultures et incubations de micro-organismes anoxiques? Nous recherchons notre futur·e chercheur·e postdoctoral·e en géomicrobiologie !
Vos missions :
Vous travaillerez aux côtés d’une doctorante qui a construit le dispositif expérimental, et vous serez impliqué-e dans le volet biologique du projet et l’étendrez avec une nouvelle expérience.
•Diriger le volet biologique de l’expérience actuelle : assurer le suivi de l’écosystème microbien (fonctions de type archéen : micro-organismes méthanogènes, méthanotrophes, sulfato-réducteurs, sulfo-oxydants et nitrate-réducteurs) dans les réacteurs incubés par rapport aux réacteurs stériles.
•Caractériser les communautés microbiennes : extraction d’ADN et métabarcoding, en collaboration avec l’équipe du Genoscope, et interprétation de la composition des communautés selon les types de roches et les conditions.
•Co-organiser une campagne de terrain au lac Pavin : échantillonner l'eau anoxique à plus de 60 m de profondeur (bouteilles Niskin, incubations de roches in situ) et rapporter les échantillons dans des conditions anoxiques pour les utiliser dans les expériences.
•Concevoir, mettre en place et mener une nouvelle expérience similaire à celle existante, en utilisant les échantillons fraîchement collectés, et publier les résultats dans des revues internationales et les présenter lors de conférences.
Sujétions particulières : poste localisé entre Nice et Paris / Île de France

Profil recherché :
Profil du candidat :
Vous êtes titulaire d'un doctorat en biologie, microbiologie, géomicrobiologie ou astrobiologie (ou dans un domaine étroitement lié) et vous manifestez un vif intérêt pour l'évolution de la Terre et les interactions entre le vivant et les minéraux.
Vous maîtrisez les techniques de microbiologie moléculaire (extraction d'ADN, PCR, métabarcoding et analyse bioinformatique des données de séquençage) et, idéalement, les techniques de culture ou d'incubation en milieu anaérobie.
Vous êtes autonome, rigoureux·se et à l'aise aussi bien dans le travail de terrain (échantillonnage en bateau sur un lac) que dans un laboratoire de géochimie.
Vous appréciez le travail d'équipe interdisciplinaire entre la géologie, la géochimie et la biologie, ainsi que la communication de vos résultats en anglais (la maîtrise du français est un atout).

L'employeur :
Université Côte d’Azur est un grand Établissement Public à Caractère Scientifique Culturel et Professionnel dont les missions fondamentales sont la Formation des étudiantes et des étudiants et des professionnelles et professionnels, une Recherche d’excellence et une Innovation au service de tous et toutes. Depuis le 1er janvier 2020, cet établissement public expérimental vise à développer le modèle du 21ème siècle pour les universités françaises, basé sur de nouvelles interactions entre les disciplines (pluridisciplinarité et transdisciplinarité), avec une volonté de dynamique collective articulant Formation-Recherche-Innovation, ainsi que de solides partenariats locaux, nationaux et internationaux avec les secteurs public et privé.

Lauréate depuis 2016 de l’Initiative d’Excellence (IDEX) avec « UCA Jedi », du projet 3IA (institut interdisciplinaire pour l’intelligence artificielle) en 2019, d’un projet d’écoles universitaires de recherche (EUR), Université Côte d’Azur est engagée dans une trajectoire de transformation et d’excellence, qui vise à lui donner le rang d’une grande université intensive en recherche à la fois ancrée dans son territoire et tournée vers l’international. Université Côte d’Azur emploie directement plus de 3 000 personnels et accueille chaque année une population de plus de 30 000 étudiantes et étudiants.