Ingénieur de recherche en bio informatique - DR - Laboratoire GBCM

Faire avancer les projets de recherche en bioinformatique du Laboratoire sous la direction du Directeur du Laboratoire, et travailler en particulier sur le projet de transcriptomique Chikgene, projet ANR, obtenu par le Laboratoire. De manière générale, ces projets portent notamment sur l’analyse de données omics de populations humaines malades et non malades avec le développement de nouveaux outils bioinformatiques d’exploitation de ces données et sur l’exploitation de ces données pour répondre aux problématiques biologiques et biomédicales posées au Laboratoire. Dans le cadre du projet Chikgene les données à traiter sont des données RNAseq de patients et de contrôles et des données de séquençage low coverage 4X.

Profil recherché :
· Niveau d'études min souhaité : BAC+5 au minimum, un doctorat dans le domaine serait très apprécié.
· Bonne connaissance de la biologie et de la physiopathogenèse des maladies.
· Domaine / Spécialisation : Biologie / Bioinformatique
· Niveau d'expérience minimum requise : 6 ans d’expérience post-Master 2, ou 3 ans post-doctorat souhaités.
Compétence attendues :
Connaissances
- Biologie générale, Immunologie, Biologie moléculaire, Génétique des populations, R, statistiques, imputation.

- Adaptabilité pour utiliser les logiciels de traitement de données omics comme : DESeq2, Metascape, DisgeNET, WGCNA, PLINK, SNPTEST, GSEA, Impute 2, Shape-IT, Predixcan, LDSC.
Savoir-faire
- Bioinformatique et traitement des données omics (ADN, ARN, réponse humorale).
Savoir-être
- Rigueur, aptitude au travail d'équipe, dynamisme, capacité à interagir avec d'autres experts
Outils
- Logiciels d’analyse des données omics (transcriptomique notamment)

L'employeur :
Le Conservatoire national des arts et métiers (Cnam) a été fondé en 1794 par l’abbé Grégoire pour perfectionner l’industrie nationale. C’est aujourd’hui un établissement public à caractère scientifique, culturel et professionnel placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche.
230 ans après sa création, le Cnam est toujours fidèle à sa devise « Omnes docet ubique » (il enseigne à tous et partout). Digne héritier de l’esprit des Lumières, il fait du savoir un levier d’émancipation sociale par le travail, en permettant à chacun de construire ses compétences et de s’accomplir professionnellement.

Les formations du Cnam – plus de 750, dans différents domaines – sont construites et dispensées en lien étroit avec les entreprises et organisations professionnelles. Aujourd’hui 80 % des parcours sont en formation continue et 20 % en formation initiale (principalement en apprentissage).
Le Cnam abrite également le musée des Arts et Métiers, au cœur de Paris, qui conserve la plus ancienne collection industrielle et technologique au monde.
Le Cnam remplit trois missions principales :
La formation professionnelle supérieure tout au long de la vie,
La recherche,
La diffusion de la culture scientifique et technique.
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Descriptif du service
Le poste est rattaché à la Direction de la recheche au sein du Laboratoire Génomique Bioinformatique Chimie Moléculaire (GBCM) qui développe des recherches en génomique, bioinformatique structurale et chimie moléculaire pour comprendre les mécanismes moléculaires des maladies humaines et développer de nouvelles approches de diagnostic, de traitement, ou de prévention.
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