Ingénieur-e pour établir la liste française des espèces d’agnathes et de poissons migrateurs amphi

Vous serez accueilli-e au sein de l’Unité Ecosystèmes Aquatiques et Changements Globaux (UR EABX) localisée à Gazinet-Cestas et appartenant au centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux. Les recherches menées par l’Unité ont pour missions de développer les connaissances, fournir des méthodes et améliorer les outils pour définir et comprendre le statut et la dynamique des écosystèmes aquatiques continentaux (i.e. estuaires, lacs, rivières) en évaluant la réponse de ces systèmes et de leurs espèces clés (dont les poissons migrateurs amphihalins migrant entre mer et rivière pour réaliser leur cycle de vie) à une gamme de pressions humaines (e.g. pêche, fragmentation, pollution, changement climatique) (https://www6.bordeaux-aquitaine.inrae.fr/eabx/EABX).

Les agnathes et les poissons migrateurs amphihalins (ou espèces diadromes) sont un des éléments remarquables de la biodiversité aquatique. L’établissement d’une liste de ces espèces, la plus exhaustive possible sur un territoire donné, est la première étape d’une gestion globale de ces assemblages. Récemment, un effort d’objectivation des critères pour qu’une espèce puisse être considérée comme migratrice amphihaline a été entrepris (Rochard et al., 2025). Une liste mondiale est en cours d’établissement avec plus de 1000 espèces candidates identifiées.
L’enjeu de ce travail est de mettre à disposition des gestionnaires de l’environnement français, une liste des espèces migratrices amphihalines qui méritent la mise en œuvre des politiques liées à ces espèces (e.g. plans de gestion des poissons migrateurs amphihalins, continuité écologique).
Ce recensement sera également utile pour l’information d’un plus large public sur la richesse dont dispose le territoire national par rapport à ces espèces.
Il permettra enfin d’identifier les lacunes dans les connaissances de ces espèces.
Vous serez plus particulièrement en charge :
de valider la liste des espèces migratrices amphihalines pour la France métropolitaine et les territoires ultramarins. Cela nécessitera :d’ajuster la base des bassins versants Hydroshed, en particulier dans les territoires ultramarins ;
de faire converger les bases d’occurrence de poissons EuroDiad (Barber-O’Malley et al., 2022) et des poissons d'eau douce à l'échelle mondiale (Tedesco et al., 2017), éventuellement de compléter EuroDiad pour les régions sous documentées ;
et de réaliser une revue de la littérature pour renseigner les critères de diadromie des espèces candidates présentes en France.
d’identifier les espèces diadromes non prises en compte dans la zone EuroDiad (Europe, Moyen-Orient, Afrique du Nord) et de commencer à renseigner leur occurrence dans la base EuroDiad.
de rédiger un rapport (ou un article scientifique) présentant :la méthodologie de recensement des poissons migrateurs amphihalins dans un territoire ;
la liste des agnathes et poissons migrateurs amphihalins en France ;
et l’actualisation de la base EuroDiad.
Vous serez accompagné-e dans votre travail par un groupe de collaborateurs avec des compétences en écologie des poissons migrateurs amphihalins, en base de données et en utilisation d’intelligence artificielle générative.
Barber-O’Malley, B., Lassalle, G., Lambert, P. & Quinton, E. (2022) Dataset on European diadromous species distributions from 1750 to present time in Europe, North Africa and the Middle East. Data in Brief 40, 107821, doi:10.1016/j.dib.2022.107821.
Rochard, É., Lambert, P. & Lassalle, G. (2025) Poissons migrateurs amphihalins, espèces diadromes : de quoi parle-t-on ? Sciences Eaux & Territoires 9421–9421, doi:10.20870/Revue-SET.2025.47.9421.

Profil recherché :
Formation recommandée : Master en écologie
Connaissances souhaitées : Revue bibliographique, programmation en langage R, versionnage GIT, maîtrise de l’anglais, connaissance en écologie des poissons.
Expérience appréciée : Requête SQL, prompt ingéniering, assemblage de poissons migrateurs amphihalins, modèle de distribution d’espèces.
Aptitudes recherchées : Appétence pour le travail bibliographique, sens de l’organisation, autonomie et prise de décision.

L'employeur :
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.

Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
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