Ingénieur-e en ingénierie logicielle

Vous rejoindrez l’Unité de Nutrition Humaine, au sein de la Plateforme d’Exploration du Métabolisme (PFEM), qui est une infrastructure scientifique collective INRAE dont l'équipe Métabolisme et Spectrométrie de Masse (MSM) est dédiée à la métabolomique. L'intérêt principal de recherche de la PFEM concerne en particulier le développement de méthodes analytiques basées sur la spectrométrie de masse et d'outils bioinformatiques pour l'étude des relations entre nutrition et santé : profilage métabolique par des approches multiplateformes dans les biofluides et les tissus, développement de stratégies analytiques pour l'identification de biomarqueurs à l'aide d'outils de spectrométrie de masse et bioinformatiques, développement de modèles et d'outils pour améliorer l'extraction de connaissances à partir de données de haut débit. La PFEM est un des membres fondateurs de l'infrastructure d'avenir MetaboHUB (MTH).

Au sein du pôle « Gestion des données et des connaissances » de l’UMS MTH-Core, vous contribuerez à la mise en œuvre, à l’évolution et au maintien en conditions opérationnelles des systèmes d’information de l’infrastructure MetaboHUB, en réponse aux besoins des projets et des utilisateurs.
Votre mission consistera en l’exploitation et de l’évolution des applications web structurantes de l’infrastructure, en particulier MAMA (portail de gestion des demandes d’analyses) et GRANDMA (outil de production et de validation de rapports). Vous assurerez leur maintenance corrective et évolutive, le support aux utilisateurs, ainsi que la conception, le développement et la documentation de nouvelles fonctionnalités, en lien étroit avec les équipes projet.
Vous interviendrez sur l’ensemble de la chaîne applicative (front-end, back-end, API, bases de données, intégration aux systèmes d’information), en appliquant les bonnes pratiques de développement logiciel, notamment en matière de tests (unitaires, d’intégration, automatisés) et d’intégration et déploiement continus (CI/CD).
Vous serez plus particulièrement en charge de :
participer à l’administration des systèmes d’information supports (environ 10% de l’activité), notamment à travers la gestion des comptes utilisateurs sur les outils collaboratifs et de développement (Nextcloud, forge logicielle INRAE) ;
contribuer au suivi du projet AgroDataRing (environ 10%), dédié à l’archivage et à la valorisation des données scientifiques. Dans ce cadre, vous interviendrez en appui aux équipes informatiques des sites distants pour l’administration des nœuds de MetaboHUB, afin de garantir une gestion cohérente, harmonisée et pérenne des données à l’échelle du consortium.

Profil recherché :
Formation recommandée : Diplôme de master 2 en bioinformatique / informatique.
Connaissances souhaitées :
Maîtrise des technologies et outils de développement web, notamment TypeScript, Webpack, React.js et Express.
Bonne connaissance des pratiques d’intégration et de déploiement continus (CI/CD), en particulier dans l’environnement GitLab (pipelines, runners).
Maîtrise de Git et des workflows associés (gestion de branches, merge requests, revues de code, versioning).
Conception et utilisation d’API REST, avec une bonne maîtrise des standards de documentation tels qu’OpenAPI.
Mise en œuvre de stratégies de tests (unitaires, d’intégration, automatisés) intégrées aux pipelines CI/CD ; utilisation d’outils d’automatisation tels qu’Ansible.
Maîtrise des bases de données relationnelles, en particulier PostgreSQL, et du langage SQL.
Sensibilité aux enjeux de sécurité applicative (authentification, gestion des autorisations, bonnes pratiques OWASP).
Capacité à produire une documentation technique claire (architecture, API, procédures d’installation et l’exploitation).
Connaissance des environnements cloud, notamment OpenStack.
La maîtrise de PHP (Symfony, Doctrine) ainsi que de Bootstrap constitue un atout.

Expérience appréciée :
Solide expérience en développement web fullstack.
Expérience en virtualisation et conteneurisation d’applications avec Docker et Docker Compose.
Pratique des outils de gestion de projets et de documentation (forges logicielles, systèmes de tickets, wikis).
Aptitudes recherchées :
Excellentes aptitudes relationnelles pour recueillir, analyser et formaliser les besoins des différentes plateformes du consortium.
Goût pour le travail collaboratif et la coopération interdisciplinaire.
Autonomie, rigueur et sens de l’organisation.
Capacité d’analyse et de résolution de problèmes.
Sens du service et attention portée aux besoins des utilisateurs.
Intérêt pour l’innovation numérique et les projets à impact sociétal.

L'employeur :
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.

Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
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