Chercheur / Chercheuse en chémoinformatique - CDD de projet 13 mois

CDD de projet 13 mois
Démarrage à compter du 01/11/2026
Catégorie : A Corps : Ingénieur de recherche
Emploi ouvert aux agents contractuels uniquement
Rémunération selon grille de la Fonction Publique
Mission
Développer et appliquer des méthodes de chémoinformatique pour l’analyse et la visualisation de l’espace chimique, l’analyse des relations structure-activité ainsi que la conception, la sélection et la priorisation de chimiothèques, dans le cadre d’un projet de 12 mois mené en étroite collaboration avec un partenaire industriel du secteur pharmaceutique. L’objectif est d’automatiser et de fluidifier ces flux de travail afin qu’ils soient reproductibles, réutilisables et transposables à l’ensemble des projets de découverte de médicaments.
Activités

Activités principales :
- Développer des flux de travail reproductibles pour le traitement, la standardisation, la représentation, la comparaison et l’analyse des structures chimiques et des données associées.
- Concevoir des visualisations claires, statiques et interactives, des espaces chimiques, des squelettes moléculaires (scaffolds), des séries d’analogues et des paysages de propriétés ou d’activités.
- Concevoir et évaluer des chimiothèques ciblées et diversifiées : couverture de l’espace chimique, analyse de diversité, sélection de sous-ensembles et priorisation des composés.
- Implémenter ces méthodes sous forme de paquets Python/RDKit maintenables, d’outils en ligne de commande, de notebooks, d’API ou d’applications légères, en collaboration étroite avec les chémoinformaticiens et les chimistes médicinaux du partenaire industriel.
Activités associées :
- Documenter, tester et maintenir les outils développés afin d’en assurer la réutilisation par le laboratoire et le partenaire.
- Participer aux réunions d’avancement régulières avec le partenaire industriel et présenter les résultats.
- Rédiger des rapports scientifiques et, le cas échéant, des publications et communications en congrès.
- Contribuer à la vie scientifique du laboratoire (séminaires, encadrement ponctuel d’étudiants).
Candidater
Pour postuler, veuillez adresser votre CV et lettre de motivation au plus tard le 21/10/2026 à l'attention de M. Dr Alexey Orlov, mail : aorlov@unistra.fr

Profil recherché :
Connaissances :
- Doctorat, de préférence en chémoinformatique ou dans un domaine proche (chimie computationnelle, modélisation moléculaire, chimie médicinale).
- Solide expertise en chémoinformatique : représentation et standardisation des structures chimiques, mesures de similarité, analyse et visualisation de l’espace chimique.
- Connaissance des approches computationnelles de conception et d’optimisation de chimiothèques.
- Maîtrise de l’anglais scientifique, à l’écrit comme à l’oral.

Compétences opérationnelles :
- Excellente maîtrise de la programmation Python et expérience pratique de RDKit ou d’une bibliothèque de chémoinformatique équivalente.
- Capacité à construire des flux de travail reproductibles et des visualisations statiques et interactives de données chimiques.
- Maîtrise de Bash/Linux, de Git et des pratiques modernes de développement logiciel : tests, packaging, intégration et déploiement continus (CI/CD), conteneurs, API, documentation et développement collaboratif.
- Une expérience des outils de codage agentiques constituerait un atout.
Compétences comportementales :
- Autonomie, rigueur scientifique et sens de l’organisation.
- Goût du travail en équipe dans un environnement international et interdisciplinaire.
- Bonnes qualités de communication et aptitude à dialoguer avec des interlocuteurs académiques et industriels.
- Discrétion et respect de la confidentialité liée au partenariat industriel.

L'employeur :
Descriptif du service
Le Laboratoire de Chémoinformatique de l’Université de Strasbourg (UMR 7140 CNRS-Unistra, « Chimie de la Matière Complexe ») développe et applique des méthodes computationnelles pour l’analyse des données chimiques et la découverte de médicaments. Le ou la chercheur.euse intégrera une équipe internationale et interdisciplinaire et travaillera sur un projet mené en partenariat avec un acteur industriel majeur du secteur pharmaceutique, sur des projets de portefeuille en découverte de médicaments